Reoviridae
| Reoviridae | ||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Rotavírusok a TEM-ben | ||||||||||||||
| Szisztematika | ||||||||||||||
| ||||||||||||||
| Rendszertani jellemzők | ||||||||||||||
| ||||||||||||||
| Tudományos név | ||||||||||||||
| Reoviridae | ||||||||||||||
| Bal | ||||||||||||||
|
A Reoviridae alkotja a burkolatlan vírusok legnagyobb családját , kettős szálú RNS - sel (dsRNS). A Birnaviridae és a Partitiviridae együtt csak ők a vírusok, amelyek dsRNS genomja szegmentált. A család olyan fontos kórokozókat tartalmaz, mint a kéknyelv-betegség vírusa , az emberi rotavírus és a coloradói kullancsláz vírus . A neve a család egy betűszó a „ r espiratory, e nteric, o rphan ”, mert úgy érezték, hogy a tagok a ennek a rendszertani csoportban csak bélbetegség ( bélben oldódó ), légzőszervi betegségek ( légzőszervi ) vagy nincs betegség ( árva ) okozna. Valójában a Reoviridae-kat számos emlősnél , valamint hüllőknél , halaknál , rákféléknél és rovaroknál találták meg . A család három nemzetségébe ( fijivírus , fitoreovírus és oryzavírus ) tartoznak a növényekben ( növényi vírusokban ) és gombákban ( mikovírusokban ) található kórokozók .
morfológia
A Reoviridae érett vírusrészecskéi ( virionjai ) köpeny nélküli, kb. 60-80 nm átmérőjű ikoszadrikus kapszidák . A család legtöbb nemzetségére jellemző (a Cypovirus nemzetség kivételével ) a két fészkes virion szerkezete. és szorosan egymásra ható kapszidák ( T = 13 ), amelyek viszont körülveszik a belső, szabályos magszerkezetet. A három fehérje rétegből felépített virionok ezért nagyon tipikus, vastag falú szerkezetet mutatnak, szabályos, küllők alakú megvastagodásokkal az elektronmikroszkóp alatt . Ebből a küllõszerkezetbõl származtatva a Rotavirus (lat. Rota : kerék) nemzetség kapta a nevét. Ezt a küllőszerkezetet a külső kapsziban lévő 132 nyílás hozza létre, amelyek ugyanannyi csatornára nyílnak a belső kapszidban. Ezek a csatornák, amelyek a belső magig terjednek, lehetővé teszik az ionok diffundálódását a virionba.
Mivel a belső mag és a belső kapszid felelős az RNS-szegmensek megfelelő csomagolásáért, a külső kapszid viszonylag nagy változékonyságot mutat a felületi struktúrákban anélkül, hogy rontaná a virion stabilitását és a genom teljességét. Ezért sok reovírus számos fajt és szerotípust mutat .
A belső maghéjban található egy vírusos RNS-polimeráz és guanil-transzferáz molekula . Egyes nemzetségekben a mirisztilcsoportok (tetradecilcsoportok) kovalensen kötődnek a kapszidhoz. A nemzetségek Rotavírus , Orbivirus és Coltivirus fordulnak elő éretlen virionok, amelyek maradékai a lipidburok. Ezekben a nemzetségek, sejtek elhagyják a sejt által bimbózó a sejtmembránon ( orbivirus , coltivirus ), vagy a membrán a endoplazmatikus retikulum (ER) ( rotavírus ). A virionok enzimatikus érlelési lépés révén ismét elveszítik a lipid burkolatot. Egyes nemzetségekben a külső kapszidot a gazda saját proteázai (pl. Tripszin , kimotripszin ) megváltoztatják, amelyek úgynevezett „ fertőző szubvírus részecskéket ” (ISVP) hoznak létre. Csak az ISVP-k fertőzőek, és az éretlen virionokról az ISVP-kre történő átmenet döntő szerepet játszik a betegség kialakulásában és a virionok különböző megnyilvánulásaiban a bélben , a nyálban vagy a vérszérumban .
Genom
A genom kétszálú RNS-ből áll, amely a nemzetségtől függően 10-12 szegmensre oszlik. A moláris tömege a szegmensek tartományok 0,2-3 × 10 6 Da . A Reoviridae vírusos mRNS-nek nincs poli-A farka . Egyes vírusfajokban rövid, egyszálú RNS oligonukleotidok találhatók a belső maghéjban.
Szisztematika
Belső rendszer
2018 novemberétől az ICTV adatai szerint a Reoviriridae a következőképpen oszlik fel (a típusfajokon kívül csak válogatás más fajokból áll):
- Reoviridae család
-
- Sedoreovirinae alcsalád
-
- Genus cardoreovirus
-
- Fajok Eriocheir sinensis reovírus (en. Eirocheir sinensis reovirus, ESRV, típusú fajok) a kínai ujjatlan rákban
- Faj „ Macropipus depurátorral vírus ” (en „ Macropipus depurátorral vírus ”, MdRV, meg nem erősített) a Decapoda
- Macropipus depurator P vírus (MdRV-P, DpPV)
- Faj " Carcinus mediterraneus vírus " (en " Carcinus mediterraneus reovírusból " CMRV, meg nem erősített) a decapods (Decapoda)
- Carcinus mediterraneus W2 vírus (CmRV-W2, CcRV-W2)
- Nemzetség Mimoreovirus
- Fajok Micromonas pusilla reovirus (en. Micromonas pusilla reovirus, MpRV, fajok)
- Genus orbivirus
-
- Faj afrikai lópestis (s. Afrikai lópestis vírus , ALPV)
- Faj kéknyelv vírus (en. A kéknyelv vírus , BTV, típusfaj)
- Faj epizootikus vérzéses betegség vírusai (s. Epizootikus vérzéses betegség vírus , EHDV)
- Faj Faj Great Island vírus
- Kemerovo vírus (en. Kemerovo vírus, KEMV)
- Faj Lebombo vírus (en. Lebombo vírus , LEBV)
- Faj Lipovnik vírus ( Lipovnik vírus , LIPV, vektor: kullancsok)
- Faj Orungo vírus (en. Orungo vírus , ORUV)
- Faj Palyam vírus (en. Palyam vírus , PALV)
- Chuzan vírus (en. Chuzan vírus, CHUV)
- Faj perui lópestis (s. Perui lópestis vírus , pHSV)
- Fajok St. Croix River vírus (en. ' St Croix River vírus , SCRV)
- Faj Tribeč vírus (szintén Tribeči vírus , en. Tribeč vírus , nem hivatalosan Tribeči vírus , TRBV)
- Faj Umatilla vírus (en. Umatilla vírus , UMAV)
- Nemzetség Phytoreovirus
- Faj sebdaganat vírus (WTV, fajok)
- Faj Rice törpe vírus (RDV)
- Nemzetség rotavírus
-
- Rotavirus A fajok (RVA, fajok)
- BoRV-A / UK
- SiRV-A / SA11
- Rotavirus B faj (RVB)
- Hu / MuRV-B / IDIR,
- Rotavirus C faj (RVC)
- PoRV-C / Co
- Faj Rotavírus D az I.
- A Seadornavirus nemzetség
- Faj Banna vírus (en. Banna vírus , BAV, fajok)
- Faj Liaoning vírus (s. Liao Ning vírus , LNV)
- Faj Kadipiro vírus (en. Kadipiro vírus , KDV)
-
- Spinareovirinae alcsalád
-
- Aquareovirus nemzetség
- Faj aquareovirus A (típusfaj)
- Faj aquareovirus B
-
-
- Az aquareovirus C faj
- Arany csillogó reovírus (GSRV)
- Amur reovírus (GCRV)
- Az aquareovirus E faj
- Faj aquareovirus G
- Genus coltivirus
- Faj Colorado kullancsláz vírus (s. Colorado kullancsláz vírus , CTFV, fajok)
- Faj Eyach vírus (en. Eyach vírus , EYAV)
- Genus cypovirus
- 1. faj Cypovirus (típusfaj)
- Faj Cypovirus 2 , hogy 16-
-
-
-
- A dinovernavirus nemzetség
- Az Aedes pseudoscutellaris vírus (en. Aedes pseudoscutellaris vírus , hivatalosan Aedes pseudoscutellaris reovírus , APRV, fajok)
- " Fakovírus " faj (javaslat)
- A Fijivirus nemzetség
- Faj Fiji betegség vírusa (típusfaj)
- Idnoreovirus nemzetség
- Faj Idnoreovirus 1 (fajok)
- Faj Idnoreovirus 2 , hogy 5
- Nemzetség mycoreovirus
- 1. faj: Mycoreovirus (típusfaj)
- 2. és 3. Mycoreovirus faj
- Orthoreovirus nemzetség
- Fajok Emlős orthoreovirus (MRV, fajok)
- Az oryzavirus nemzetség
- Faj Rizs rongyos kaszkadőr vírus (RRSV, fajok)
- Fajok Echinochloa rongyos kaszkadőr vírus
-
- Besorolatlan vírusfajok a Reoviridae családba:
-
- Faj " Buthus occitanus reovírusból " (en " Buthus occitanus reovírusból ", "BoRV") a skorpiók a család Buthidae
- A " Cimex lectularis reovirus " (en. " Cimex lactularius reovirus ", "ClRV") faj a Cimex lectularius poloskában
- A " Porcellio-dilatatus reovirus " (" Porcellio dilatatus reovirus ", "Pdrv") faj a Porcellio dilatatus faj szárazföldi izopodáin (Isopoda: Oniscidea)
- Faj " Scylla serrata reovírus " (en. " Scylla serrata reovírus ", " Mud rák reovírus ", "SsRV" vagy "MCRV")
- SsReV-SZ (SZ-2007) a Scylla nemzetség úszórákjaiban ( Scylla serrata faj , angol sárrák )
- " Operophtera brumata reovirus " (en. " Operophtera brumata reovirus", "ObRV") faj a kis fagykulcsban
-
Az alábbi kladogram egyszerűsített ábrázolást ad a családi kapcsolatokról, amint azt a Nemzetközi Vírusrendszertani Bizottság 9. jelentése (ICTV, 2011) és MacLachlan / Dubovi (2016) leírja; valamint szinte következetesen Belhouchet és mtsai. (2010) javasolta:
| Reoviridae |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|
Néhány nemzetségfaj esetében a rövidített nevek vannak megadva, ezek mindegyike tartalmazza a vizsgált társult egy vagy több törzset ( angol törzsek ).
Régebbi vizsgálatokban még mindig vannak bizonyos eltérések (pl. Attoui et al. (2006), Quito-Avila (2011) és Ke et al. (2010).
Külső rendszer
A Mester fajlista # 35 március 2020 az ICTV rendelt a Reoviridae hogy az újonnan létrehozott Törzs Duplornaviricota . Kladogram megtalálható a Picornavirales §ICTV 35. számú törzsfaj-listáján .
dagad
- PPC Mertens, C. Wei, B. Hillmann: Reoviridae család. In: CM Fauquet, MA Mayo és mtsai. : A vírusok taxonómiájával foglalkozó nemzetközi bizottság nyolcadik jelentése. London, San Diego, 2004, 447-555.
- S. Mordrow, D. Falke, U. Truyen: Molekuláris virológia. 2. kiadás, Heidelberg / Berlin 2003, ISBN 3-8274-1086-X .
internetes linkek
- Reoviridae (NCBI)
Egyéni bizonyíték
- ↑ ICTV fő fajlista 2018b v1 MSL # 34, 2019. február
- ↑ a b c d e ICTV: Kéknyelv-betegség vírus , EC 51, Berlin, Németország, 2019. július; E-mail megerősítése 2020. március (MSL # 35)
- ↑ ICTV : Fő fajlista 2018a v1 MSL, beleértve az összes taxon frissítést a 2017-es kiadás óta. 2018 ősze (MSL # 33)
- ↑ a b c d e f ICTV : dsRNS vírusok: Reoviridae , in: ICTV 9. jelentés (2011), az ICTV 9. jelentése könyvként
- ↑ SIB: Orbivirus , be: ViralZone
- ↑ SIB: Cypovirus , bekapcsolva: ViralZone
- ↑ NCBI: Fako vírus (faj)
- ↑ SIB: Orthoreovirus , on: ViralZone
- Elly Kelly Simone Bateman et al. : A rákokat megfertőző vírusok taxonómiai áttekintése, különös tekintettel a vadgazdákra. In: Gerinctelenek patológiájának folyóirata. 147., 2017. január, doi: 10.1016 / j.jip.2017.01.010
- ↑ N. James MacLachlan, Edward J. Dubovi: Fenner állatorvosi Virology. 5. kiadás, 2016, ISBN 978-0-12-800946-8 , doi: 10.1016 / C2013-0-06921-6 .
- ↑ Mourad Belhouchet és mtsai. : A Great Island vírus teljes szekvenciája és összehasonlítás a Kemerovo, Lipovnik és Tribec vírusok T2 és külső kapszid fehérjéivel (Orbivirus nemzetség, Reoviridae család). In: Journal of General Virology. 91 (Pt 12): 2985-2993, 2010. december, doi: 10.1099 / vir.0.024760-0
- ↑ Houssam Attoui és mtsai: Micromonas pusilla reovirus : A Reoviridae család új tagja, egy új javasolt nemzetséghez (Mimoreovirus) hozzárendelve. In: Journal of General Virology. 87 (Pt 5), 1375-1383, 2006. június, doi: 10.1099 / vir.0.81584-0 .
- ↑ Diego F. Quito-Avila et al. : A málna látens vírus teljes szekvenciája és genetikai jellemzése, a Reoviridae család új tagja. In: Víruskutatás. 155. évfolyam, 2. szám, 2011. február, 397–405. Oldal, doi: 10.1016 / j.virusres.2010.11.008 .
- ↑ FJ Ke, LB He és mtsai: A nagy rombusz-reovírus (SMReV) genom, amely egy FAST fehérjét kódol egy nem AUG kezdőhellyel. In: BMC Genomika. 2010, doi: 10.1186 / 1471-2164-12-323 .
- ↑ ICTV: ICTV Master Species List 2019.v1 , Új MSL, beleértve az összes taxon frissítést a 2018b kiadás óta, 2020 márciusa (MSL # 35)