Geminiviridae

Geminiviridae
Tisztított kukorica csík vírus (MSV), a skála 50 nm-nek felel meg.
Szisztematika
Besorolás : Vírusok Birodalom : Monodnaviria Birodalom : Shotokuvirae Menhely : Cressdnaviricota Osztály : Repensiviricetes Rendelés : Dugult vírus Család : Geminiviridae
Rendszertani jellemzők
Genom : (+/-) ssDNS kör alakú Baltimore : 2. csoport Szimmetria : dimer - ikozaéder Borító : nem
Tudományos név
Geminiviridae
Bal
NCBI  rendszertan: 10811 ViralZone ( ExPASy , SIB): 109. ICTV Taxon előzmények: 201903169

A Geminiviridae a DNS-vírusok családja, amely különböző növényfajokat fertőz meg. Különböző rovarok továbbítják őket . Ezek a kórokozók a mezőgazdasági jelentőségű.

Építkezés

Virion

Az ikrek vírusainak sematikus rajza.

A virionok (vírusrészecskék) a geminivírusok van egy unenveloped kapszid , amely körülbelül 38 nm hosszúságú  , és körülbelül 22 nm átmérőjű. A kapszidnak a hosszú oldal fele mentén szűkülete van. Az összehúzódás a kapszidot két nagyjából egyenlő felére osztja az ikozaéderes szerkezetnek, háromszögelési számmal , amelyből a Geminiviridae ( latin gemini , ikrek ) név származik. A vírusos egyszálú (+) - szálú DNS a kapszidba van csomagolva a gazdasejt magjában .

Genom

Geminivírusok van - mint cirkovírusokat és nanoviruses - viszonylag kis genom egy egyszálú cirkuláris DNS-molekula, amelynek ambiszensz - polaritású körülbelül 2,5-3,1 kilobázis hosszúságú két szemközti nyitott leolvasási keretet . Egyes begomovírusoknál (pl. AbMV) a genom két részből áll ( angol bipartit ), két-két, egyenként 2,6-2,8 kilobázisú DNS-szálból, ezért csak két különböző genom felű begomovírussal fordulhat elő fertőzés. Geminivírusok eredhet egy plazmid a fitoplazma spp. keletkezett. A genomjában geminivírusok lehet rekombináció , ha két vagy több geminivírusok a co-fertőzött . A genom replikálódik a gazdasejt DNS-polimeráz a sejtmagban egy növényi sejt alkalmazásával orsókoszorút replikáció . A Rep vírusfehérje a replikáció kezdetén levágja a vírus DNS-ét, és így megindítja a replikációt. Replikáció kezdődik fordított ismétlődések a konzervált Nonanukleotid szekvenciát T A ATATTA C , amely lehet egy törzs hurok - szekunder struktúra képződik.

Fehérjék

A genom kódokat a fehérjék Rep és CP (a English burokfehérje , burokfehérje ). Rep egy endonukleáz és kezdeményezi replikációját a virális genom. A CP a kapszid fehérje és a genom replikációjának elengedhetetlen része.

Replikációs ciklus

A sejtbe történő felszívódás után a geminivírusokat a citoszolból a magba szállítják a mag importálásával. Rep itt megindítja a vírus DNS replikációját a gazdasejt DNS polimerázával, a CP és a transzkripció részvételével . A vírusos mRNS a citoszolba kerül, ahol a vírusfehérjék a riboszómán termelődnek. A vírusfehérjék a sejtmagba szállulnak, felhalmozzák és megkötik a vírus DNS-ét, ezáltal a virionok képződnek. A vírusok többek között rügyképzéssel távoznak a sejtből. Eddig nem világos, hogy az átvitel virionokon keresztül vagy dezmoszómákon keresztül valósul meg kötött CP- vel rendelkező vírus DNS-en keresztül .

Szisztematika

A Geminiviridae az egyszálú DNS-vírusok legnagyobb családja. A különféle kabócák mastrevirusai ilyeneket továbbítanak. B. A kukorica széria vírus és afrikai streak vírusok által Cicadulina mbila ( törpe mezei kabócák ). Curtoviruses és topocuviruses kerülnek továbbításra a púpos Csippantás , például B. a paradicsomos álgöndör felső vírus, a Micrutalis malleifera ( Smiliinae ) által. Begomoviruses kerülnek továbbításra a molytetű Bemisia tabaci .

2021. június 22-től a Geminiviridae családba a következő nemzetségek tartoznak (a korábbi típusú fajokat (*) jelöli):

• Nemzetség Becurtovirus

• Faj Cukorrépa göndör felső iráni vírus (*)
• Faj Exomis microphylla látens vírus
• Faj Spenót göndör felső Arizona vírus (más néven Spenót súlyos göndör felső vírus )

• Begomovirus nemzetség (a fajokat lásd a célcikkben )
• Nemzetség Capulavirus

• Faj lucerna levél göndör vírus
• Faj Euphorbia caput-medusae látens vírus (*)
• Faj francia bab súlyos levélgöndör vírus
• Faj Plantago lanceolata látens vírus

• Nemzetség Citlodavirus

• Faj Citrus klorotikus törpe társult vírus (*)
• Faj Papírfaeper levél göndör vírus 2
• Faj Passion fruit chlorotic fottle virus

• Curtovirus nemzetség

• Az ágyi göndör felső vírus (*)
• Faj Torma göndör felső vírus
• Faj Spenót súlyos göndör felső vírus

• Nemzetség Eragrovirus (monotípus)

• Faj Eragrostis curvula széria vírus (*)

• Nemzetség Grablovirus

• Faj Grapevine vörös foltos vírus (más néven Grapevine Cabernet Franc-asszociált vírus , Grapevine Redleaf-társult vírus , Grapevine vörös foltos asszociált vírus , GRBaV, *)

• Faj Prunus látens vírus

• Nemzetség Mastrevirus

• Az Axonopus compressus csík vírusfaj
• Faj Bromus catharticus striate mozaik vírus (de. Trespen-Mosaikvirus ?)
• Faj Csicseriborsó klorózis Ausztrália vírus
• Faj Csicseriborsó chlorosis vírus
• Faj Csicseriborsó klorotikus törpe vírus
• Faj Csicseriborsó vöröslevelű vírus
• Faj csicseriborsó vöröslevelű vírus 2
• Faj Csicseriborsó sárga törpe vírus
• Faj Csicseriborsó sárgás vírus
• Faj Chloris sztriatív mozaik vírus
• Faj Digitaria ciliáris barázdás mozaik vírus
• Faj Digitaria didactyla barázdás mozaik vírus
• Digitaria faj vírus
• Faj Dragonfly-hoz társított mastrevirus
• Faj Eleusine indica társult vírus
• Faj Eragrostis kisebb csíkos vírus
• Faj Eragrostis csík vírus
• Fajok Kukorica csík törpevírus
• Faj Kukorica csík Reunion vírus
• Faj kukorica csík vírus Kukorica csík vírus (*)
• Fajok Maize striate mozaik vírus
• A Melenis repens társult vírus
• Faj Miscanthus csík vírus
• Faj zab törpe vírus (ODV)
• Faj Panicum csík vírus
• Fajok Paspalum dilatatum striate mozaik vírus
• Faj Paspalum striate mozaik vírus
• Faj Rizs látens vírus 1
• Faj Rizs látens vírus 2
• Faj Saccharum csík vírus
• Faj Sorghum arundinaceum társult vírus
• Faj Sporobolus striate mozaik vírus 1
• Faj Sporobolus striate mozaik vírus 2
• Faj Cukornád klorotikus csík vírus
• Faj Cukornád csík Egyiptom vírus
• Faj Cukornád csík Reunion vírus
• Faj Cukornád csík vírus
• Faj Cukornád striate vírus
• Faj Cukornád fehér csík vírus
• Faj Édesburgonya tünetmentes vírus 1
• Fajok Switchgrass mozaik társult vírus
• Faj Dohány sárga törpe vírus
• Faj Urochloa csík vírus
• Faj Búza törpe indiai vírus
• Faj Búza törpe vírus ( árpa törpe vírussal , BDV)

• Mulcrilevirus nemzetség

• Faj Mulberry crinkle leaf virus (alias Mulberry mozaik törpe asszociált vírus , *)
• Faj Papírfaeper levél göndör vírus 1

• Genus Opunvirus (monotipikus)

• 1. faj Opuntia vírus (de. Opuntia vírus 1 , *)

• Nemzetség Topilevirus

• Faj Paradicsomos apikális levélgöndör vírus (*)
• Faj Tomato geminivirus 1 (de. Tomato Geminivirus 1 )

• Genus Topocuvirus (monotipikus)

• Faj Paradicsom álgöndör felső vírus (*)

• A Turncurtovirus nemzetség

• A fehérrépa göndör felső vírusa (*)
• Faj Fehérrépa levéltekercs vírus

Javasolt a clade / nemzetségek / faj a Geminiviridae nélkül pontos hozzárendelés:

• Nem (?) " Baminivirus " (" Ba ngkok ge mini- like virus ", BamiV)
• Nem (?) " Niminivirus " (" Ni geria ge mini- like virus ", NimiV)

Segítő vírusok

A Geminiviridae szolgálhat helpervírusok a műholdas vírusok a család Tolecusatellitidae és alcsalád Geminialphasatellitinae az a Alphasatellitidae .

irodalom

• GP Martelli és mtsai. : Geminiviridae család. In: AMQ King, MJ Adams, EB Carstens, EJ Lefkowitz (szerk.): Vírusrendszertan. A vírusok taxonómiájával foglalkozó nemzetközi bizottság kilencedik jelentése. Amszterdam 2012, ISBN 978-0-12-384684-6 .
• DM Knipe, Peter M. Howley , DE Griffin, (szerk.): Fields Virology. 5. kiadás. Lippincott Williams & Wilkins, Philadelphia 2007, ISBN 978-0-7817-6060-7 .

web Linkek

• MeSH Geminiviridae
• Vírusos zóna : Geminiviridae
• ICTV: Vírusok indexe - Geminiviridae. In: ICTVdB - Az univerzális vírusadatbázis, 4. verzió. Büchen-Osmond, C. (szerk.), Columbia Egyetem, New York, 2009. ncbi.nlm.nih.gov
• A növényi vírusok leírása
• MicrobiologyBytes: Növényi vírusok ( Memento 2012. december 16-tól a webarchívumban archive.today )

Egyéni bizonyíték

1. B ^{a b c d e} ICTV: ICTV Taxonomy history: Maize streak virus , EC 51, Berlin, Németország, 2019. július; E-mail megerősítése 2020. március (MSL # 35)
2. ^ SM Gray, N. Banerjee: A növényi és állati vírusok ízeltlábúak átadásának mechanizmusai . In: Microbiol Mol Biol Rev. Volume 63 , no. 1. , 1999. o. 128-148 , PMID 10066833 , PMC 98959 (ingyenes teljes szöveg). 
3. ↑ M. Krupovic, JJ Ravantti, DH Bamford: Geminiviruses: mese arról, hogy egy plazmid vírussá válik . In: BMC Evol Biol . szalag 2009., 9. o. 112 , doi : 10.1186 / 1471-2148-9-112 , PMID 19460138 , PMC 2702318 (ingyenes teljes szöveg) - ( biomedcentral.com [PDF]). 
4. ↑ R. Chasan: geminivírusok: A Twin megközelítés replikáció . In: Növénysejt . szalag 7 , no. 1995, 6. o. 659-661 , doi : 10.1105 / tpc.7.6.659 ( plantcell.org [PDF]). 
5. ↑ ^{a b c} ZKBS : A ZKBS nyilatkozata a Geminiviridae család alábbiakban felsorolt ​​donor- és befogadó organizmusaként felsorolt, géntechnológiai munkákhoz kapcsolódó kockázatértékelésről a GenTSV 5. § (1) bekezdése szerint: ... , Az.: 6790-10 -98, 2010. szeptember
6. ^ C. Gutierrez: ÚJ EMBO TAGJAINKRÓL ÁTTEKINTÉS: a DNS-replikáció és a sejtciklus növényekben: tanulás geminivírusok . In: EMBO . szalag 19 , no. 5 , 2000, pp. 792-799 , doi : 10.1093 / emboj / 19.5.792 , PMID 10698921 , PMC 305619 (ingyenes teljes szöveg). 
7. ↑ ICTV: ICTV törzsfajlista 2020.v1 , Új MSL, beleértve az összes taxon frissítést a 2019-es kiadás óta, 2021 március (MSL # 36)
8. ↑ SIB: Begomovirus , on: ViralZone
9. ↑ SIB: Curtovirus , bekapcsolva: ViralZone
10. ↑ S. Poojari, OJ Alabi, VY Fofanov, RA Naidu: A levélszóróval átvihető DNS-vírus új evolúciós vonallal a geminiviridae családban, amely a szőlő vöröslevelű betegségében szerepet játszik a következő generációs szekvenálással . In: PLoS One. 8. (6), 2013, E64194. doi: 10.1371 / journal.pone.0064194
11. ↑ Red Blotch Rising - SevenFifty Daily . 2019. február 6.. Letöltve: 2018. március 22.
12. ^ Cornell és UC Davis új vírust azonosít a vörös foltos betegséggel - szőlőtermesztés és borászat . Letöltve: 2019. február 6.
13. ↑ SIB: Mastrevirus , on: ViralZone
14. ↑ NCBI: Árpa törpe vírus (nincs rangsor)
15. ↑ SIB: Topocuvirus , bekapcsolva: ViralZone
16. B ^{a b} Terry Fei Fan Ng, Rachel Marine, Chunlin Wang, Peter Simmonds, Kapusinszky Beatrix, Ladaporn Bodhidatta, Bamidele Soji Oderinde, K. Eric Wommack, Eric Delwart: Különböző eredetű ismert és új RNS- és DNS-vírusok sokfélesége kezeletlenül szennyvíz . In: J Virol. , 6. évfolyam, 2. szám), 2012. október 18., 12161-12175. doi: 10.1128 / JVI.00869-12
17. ↑ NCBI: Baminivírus (faj)
18. ↑ ^{a b} Achim Quaiser, Mart Krupovic, Alexis Dufresne, André-Jean Francez, Simon Roux: A kiméra vírusok sokfélesége és összehasonlító genomikája a Sphagnum által uralt tőzeges területeken , in: Virus Evolution, 2. évfolyam, 2. szám, 2016. július / október, vew025, doi: 10.1093 / ve / vew025 . Esp. 3. ábra
19. ↑ NCBI: Niminivírus (faj)